نعت منظمة المؤتمر الإسلامي في بيان،ااية الله السيد محمد حسين فضل الله بكثير من الأسى والتأثر، وقالت في بيان لها ننعي إلى العالم الإسلامي، المرجع الشيعي، العلامة محمد حسين فضل الله، والذي وافته المنية عن عمر يناهز خمسة وسبعين عاما بعد معاناة طويلة مع المرض. تغمده الله الفقيد بوافر رحمته وأسكنه فسيح جناته". وتابع البيان:" يشكل رحيل العلامة فضل الله خسارة للأمة الإسلامية، حيث عاش الرجل عمره مخلصا جهده في خدمة وطنه وقضايا أمته ورمزا للتقارب بين المذاهب، مسخرا جهده لرأب الصدع وتخفيف التوتر في لبنان وعلى صعيد العالم الإسلامي. وبهذا المصاب الجلل، تفقد الأمة الإسلامية واحدا من أبرز الشخصيات الإسلامية التي اضطلعت بدور مهم في دعم التضامن الإسلامي".
وختم:" وبهذه المناسبة الأليمة، يتقدم الأمين العام لمنظمة المؤتمر الإسلامي، اكمال الدين إحسان أوغلى، بخالص التعازي لرئيس الجمهورية ميشال سليمان، ورئيس   مجلس النواب نبيه بري ورئيس مجلس الوزراء سعد الحريري، داعيا الله جلت قدرته أن يتغمد الفقيد بواسع رحمته ورضوانه. كما يتقدم بأصدق المواساة القلبية للشعب اللبناني ولأفراد أسرة الفقيد، داعيا المولى جلت قدرته أن يلهمهم جميل الصبر والسلوان".